ProEtnica 2009 își propune să ofere comunităților etnice și organizațiilor de migranți din România o voce publică și posibilitatea de a-și prezenta toate domeniile vieții sociale, culturale și spirituale prin diverse forme culturale și academice și metode variate. Astfel programul festivalului este unul bogat, variat și bine structurat în patru arii tematice:

1) Aria științifico-culturală se desfășoară zilnic între orele 11:00 și 13:00 și între 15:00 și 17:00 în fiecare zi a celor 9 zile de festival, în care vor fi organizate pe de o parte prelegeri, mese rotunde, simpozioane etc., iar pe de altă parte lansări de carte, spectacole de teatru și acte culturale care nu se adresează unei largi audiențe.
2) Programul artelor spectacolului se desfășoară zilnic între orele 17:00 și 23:00 și constă în spectacole tradiționale de dansuri, muzică și cor, derulate pe scena principală din Piața Cetății a Sighișoarei. Un principiu de bază al ProEtnica este stimularea inter-acțiunii și între reprezentanții comunităților etnice și publicul pe scena interactivă din Piața Muzeului, precum și între diferitele ansambluri ale organizațiilor participante. Astfel între orele 21:00 și 22:00 organizăm spectacole comune cross-culturale ale minorităților și un bal intercultural, unde comunitățile au posibilitatea de a-și repeta programul sau de a interacționa cu vizitatorii într-un context non-formal.